Skripta se zabývají obecnou a systematickou mikrobiologií s aplikacemi v technologiích vod. Obsahují informace o legislativě, hygieně, hydrobiologii, hydrochemii, genetice, biochemii a technologiích úpravy vody a čištění odpadních vod. První kapitola představuje mikrobiologii, její obory (virologie, bakteriologie, mykologie), historii a aplikovatelnost. Druhá kapitola se zaměřuje na nebuněčné organismy, jako jsou viry a priony, a jejich reprodukční strategie. Třetí kapitola popisuje buněčné organismy, včetně prokaryotických (archebakterie, eubakterie) a eukaryotických (houby), a jejich strukturu, morfologii a systematické členění. Čtvrtá kapitola se věnuje abiotickým faktorům ovlivňujícím výskyt mikroorganismů a ekologickým vztahům mezi nimi. Pátá kapitola se zaměřuje na růst a rozmnožování prokaryotických a eukaryotických organismů. Následující kapitoly se věnují metabolismu, cyklům syntézy a štěpení biomolekul, indikátorům znečištění vod a základům genetiky. Desátá kapitola shrnuje mikrobiologické vyšetřování vzorků a metodiky detekce mikroorganismů. Jedenáctá kapitola specifikuje systémové prvky jakosti a hygienické indikátory, zatímco dvanáctá kapitola obsahuje terminologický slovník. Třináctá kapitola nabízí doporučenou literaturu pro další studium.
