Jako profesor teologie se John O'Malley specializuje na historii náboženské kultury raného novověku v Evropě, zejména v Itálii. Jeho práce se hluboce zabývá kulturním a historickým kontextem náboženských událostí, jako jsou koncily a rozvoj náboženských řádů. O'Malleyho analýzy osvětlují, jak minulost formuje současnost, a nabízejí čtenářům nový pohled na vývoj náboženských institucí a umění. Jeho rozsáhlé přednášky a publikace, často překládané do mnoha jazyků, zdůrazňují jeho význam jako předního historika náboženství.
Když byl zvolen do čela církve papež František, vzrostl zájem o jezuitské prostředí, ze kterého vyšel – co je to Tovaryšstvo Ježíšovo, jak se liší od ostatních náboženských řádů a jak ovlivnilo svět? Renomovaný historik John W. O’Malley, sám člen řádu, nás provádí historií Tovaryšstva Ježíšova od zakladatele Ignáce z Loyoly do současnosti. Tato kniha je úsporným a hutným dílem, vhodným úvodem pro každého, kdo se zajímá o církevní dějiny.