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Bioinformatik

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Wie berechnet man multiple Alignments und nutzt Datenbanken zur Analyse von Sequenzen? Dieser Leitfaden führt leicht verständlich in die Bioinformatik ein, ohne dass tiefgehende Informatikkenntnisse erforderlich sind. Der Fokus liegt auf den Grundlagen und Methoden der Sequenzanalyse. Zunächst werden wichtige Sequenzdatenbanken wie NCBI und EMBL sowie verschiedene Motivdatenbanken vorgestellt. Es folgen einfache Methoden des paarweisen Sequenzvergleichs, einschließlich globaler und lokaler Alignments, sowie die gängigsten heuristischen Verfahren der Datenbanksuche (FASTA und BLAST). Der Leser lernt auch, wie man multiple Alignments und phylogenetische Bäume berechnet. Neu sind Erläuterungen zu Genomanalyse und Algorithmen zur Genvorhersage. Zu jeder Methode werden Online-Tools und freie Software angegeben, sodass die Leser die beschriebenen Methoden selbstständig anwenden können. Die Autorin, eine erfahrene Molekularbiologin in der Bioinformatik, teilt ihre Expertise aus der Betreuung eines Bioinformatik-Kurses. Das Buch richtet sich an Anwender und Einsteiger, insbesondere Studenten und Forscher der Naturwissenschaften, die sich mit Sequenzanalysen beschäftigen oder ihre Kenntnisse auffrischen möchten.

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Bioinformatik, Andrea Hansen

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2001
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