Methoden zum homogenen Zugriff und zur Integration heterogener, biologischer Datenquellen mittels beschränkter Zugriffsmuster

Der Fortschritt in der Molekularbiologie, mit dem Ziel der Erfassung von Gesamtzusammenhängen komplexer biologischer Systeme, bedingt steigende Erfordernisse an die elektronische Datenverarbeitung. In diesem Zusammenhang wird das Internet als primäres Medium zur Veröffentlichung von Forschungsergebnissen in Form verschiedener Datenbanken genutzt. Neben einer umfassenden technischen Charakterisierung öffentlicher Datenbanksysteme der Molekularbiologie, liegt der Fokus auf der Unterstützung eines integrativen und homogenen Datenbankzugriffs. Der Anspruch ist die Umsetzung einer in der bioinformatischen Praxis realisierbaren Lösung, die über akademisch, theoretische Lösungsstrategien hinausgeht. Dies wird durch das, vom Autor entwickelte, Datenbankintegrationsmodell RIND und dessen Umsetzung in Form des Open-Source-Datenbankintegrationssystems BioDataServer realisiert. Die Anwendbarkeit dieser Software wird anschaulich anhand mehrerer Bioinformatikanwendungen demonstriert. Matthias Lange, geb. 1973 in Magdeburg, studierte Informatik in Magdeburg. Nach Tätigkeiten als wissenschaftlicher Mitarbeiter in verschiedenen Forschungsprojekten an der Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg ist er seit 2002 am Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK) in Gatersleben als Bioinformatiker beschäftigt.