Tato série sleduje osudy dvou mladých kočičích ninjů, kteří po zničení svého klanu bojují o přežití. Spojují své síly s odvážným samurajem, aby odhalili spiknutí a očistili jméno svého přítele. Je to dobrodružný příběh plný akce, přátelství a odhodlání v nebezpečném světě plném intrik.
Koťata Airi a Čie jsou vše, co zbylo z kočičího ninja klanu. Přežívají jen díky trikům a shovívavosti jejich přítele šiba samuraje Sena. Když je však nespravedlivě obviněn z vraždy, je na nich, aby se vydaly po stopách tajemného vraha a pokusily se Sena očistit.
Po celém Japonsku dochází ke stále častějším útokům Tenguů. bohužel nejsou jediný problém, se kterým se musí Miku, coby nově jmenovaný šógun, vypořádat. Psí samurajové velmi lpí na tradicích a jen velmi těžce nesou, že jejich řady rozšířila kočičí trojice Airi, Čie a Šisan. Nevraživost psů a koček má ale patrně daleko hlubší kořeny, než si kdokoliv chce připustit, a Miku nezbývá než řešit jeden problém po druhém.